AFS日本協会の事業は、日本の高校生を海外に派遣する「派遣事業」と、海外の高校生を日本に受け入れる「受入事業」の2本柱で成り立っています。ともにメインプログラムは1学年間の交換留学プログラムで、参加生はホームステイをしながら地域社会の一員として生活することで、ホストファミリーや地域ボランティアは彼らをサポートしながら異文化を体験することで、文化・社会・人間への理解を深めます。
また、異文化体験や国際交流のより広いニーズに応えるために、語学研修や文化研修を軸とした1ヵ月程度の短期プログラムも企画・運営しています。

1947年

　11カ国52名の大学生・高校生がアメリカに派遣される。AFS交換留学プログラムの開始

1954年

　日本人高校生8名が、日本初の高校生交換留学生としてアメリカへ派遣される。

1955年

　帰国した第1期生が、AFS日本支部を創立

1957年

　アメリカから9名の高校生を日本へ受入れる。短期受入プログラムの開始

1963年

　年間受入プログラムの開始

1972年

　アメリカ以外の国からの受入れを開始。 最初の国はノルウエー

1973年

　アメリカ以外の国への派遣を開始。最初の国はコスタリカ、デンマーク、フランス

1980年

　文部省（現文部科学省）の許可を受け、財団法人エイ・エフ・エス日本協会となる

1982年

　短期派遣プログラムの開始

1992年

　特定公益増進法人の認可を受ける

2004年

　文部科学省より「国際交流功労者文部科学省大臣表彰」を受ける

2011年

　新公益法人制度に基づく公益財団への移行が認定され、「公益財団法人AFS日本協会」として移行登記